西南海岸為臺灣沿近海養殖漁業的要地，尤其七股潟湖是全臺灣最大的海岸潟湖，保留較多的自然環境和傳統的生活方式，因時代變遷快速，近半世紀七股地區漁民主要生計養殖漁業，面臨重大變革與衝擊。西南海岸觀測站為了了解七股地區潟湖生態系統與漁村社區發展的健康情形，故透過水質、底質及漁撈生物的調查環境生態項目，還有海岸變遷的遙測資料，加上透過利害關係人訪談及問卷調查的社會科學方法，及外部槓桿七股地區的公開資料，以長期追蹤其社會生態之變化。